5月中旬至7月中旬，省委巡視組按照云南省委統一部署，采取“一托N”的方式，對省委宣傳部、省委省直機關工作委員會等29個單位開展為期2個月左右的巡視。5月12日—17日，10個巡視組已全部進駐動員完畢。此輪巡視在臨近省委換屆時進行，特點鮮明。
政治巡視更加突出。4月28日下午，省委常委會聽取我省今年第一輪巡視情況匯報時強調：“政治巡視要更加深化，巡視全覆蓋要更加高效”。本輪巡視明確要求，全省各級黨組織和廣大黨員干部，特別是巡視干部要切實增強“四個意識”，增強政治警覺性和政治鑒別力，不斷提升思想政治水平和業務素質能力，聚焦全面從嚴治黨，緊扣“六項紀律”，緊盯“三大問題”，緊抓“三個重點”，在政治高度上突出黨的領導，在政治要求上抓住黨的建設，在政治定位上聚焦全面從嚴治黨，進一步發現問題，形成震懾，倒逼改革，促進發展。
巡視任務更加明確。5月9日，第二輪巡視工作動員部署會召開，明確了2016年第二輪工作任務和10個省委巡視組組長、副組長的授權決定。省委巡視組采取“一托二”、“一托三”的方式對29個單位進行巡視，抓好對4個黨組織巡視“回頭看”。各巡視組高舉政治巡視大旗，增強“四個意識”，找出“看齊”的差距。用“四個意識”去衡量被巡視黨組織，瞪大眼睛、拉長耳朵，找準問題，切實將巡視的“國之利器”、“黨之利器”作用發揮出來，使巡視真正成為全面從嚴治黨的重要支撐、黨內監督的重要方式。
統籌協調更加到位。省委巡視機構召開情況通報協調會，進一步統一思想，凝聚合力，對協作單位和被巡視單位落實巡視前情況通報工作進行安排部署。紀檢、組織、政法、檢察、審計等機關部門以及被巡視單位積極配合巡視工作，報送材料更加及時，通報情況更加客觀準確、更加符合工作需要，部門工作責任得到很好落實。協作單位（部門）向省委巡視機構提供29個被巡視單位的相關線索共78條（件），省委巡視辦將相關線索梳理后分送10個巡視組，為巡視工作有序推進提供重要保證。
隊伍建設更加有力。一是著力提升業務能力。5月11日，省委巡視機構舉辦2016年第二輪巡視入駐前業務培訓會，進行專題業務培訓，專門邀請中央巡視辦四處處長陳健作專題輔導，省委第九巡視組正處級紀檢監察員張澤斌作了參加中央巡視組巡視信訪工作經驗交流。二是著力發揮基層組織作用。省委巡視機構黨支部積極加強思想政治工作，制定學習計劃，認真開展“兩學一做”學習教育，嚴格落實組織學習制度，發揮好黨組織的戰斗堡壘作用。三是強化紀律約束。建立違規懲戒機制，堅持用鐵的紀律打造忠誠干凈擔當巡視隊伍，維護省委巡視工作的形象和公信力，做尊崇黨章、遵守黨紀黨規的先行者，始終忠誠于黨、忠誠于人民，始終守住自身干凈的行為底線。（省委巡視辦）